Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPY3

CD93, Complement component C1q receptor, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD93Q9NPY3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD93Q9NPY3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CD93Q9NPY3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms