Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC2

KCNK9, Potassium channel subfamily K member 9, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK9Q9NPC2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNK9Q9NPC2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNK9Q9NPC2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNK9Q9NPC2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNK9Q9NPC2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNK9Q9NPC2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNK9Q9NPC2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNK9Q9NPC2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNK9Q9NPC2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNK9Q9NPC2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNK9Q9NPC2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCNK9Q9NPC2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCNK9Q9NPC2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCNK9Q9NPC2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCNK9Q9NPC2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNK9Q9NPC2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms