Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP4F12Q9HCS2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYP4F12Q9HCS2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms