Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIOBPQ9H2D6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms