Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1X1

RSPH9, Radial spoke head protein 9 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH9Q9H1X1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RSPH9Q9H1X1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RSPH9Q9H1X1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RSPH9Q9H1X1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RSPH9Q9H1X1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RSPH9Q9H1X1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RSPH9Q9H1X1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RSPH9Q9H1X1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RSPH9Q9H1X1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RSPH9Q9H1X1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RSPH9Q9H1X1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RSPH9Q9H1X1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RSPH9Q9H1X1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RSPH9Q9H1X1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RSPH9Q9H1X1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RSPH9Q9H1X1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RSPH9Q9H1X1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RSPH9Q9H1X1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RSPH9Q9H1X1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RSPH9Q9H1X1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RSPH9Q9H1X1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RSPH9Q9H1X1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RSPH9Q9H1X1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RSPH9Q9H1X1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RSPH9Q9H1X1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RSPH9Q9H1X1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RSPH9Q9H1X1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RSPH9Q9H1X1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RSPH9Q9H1X1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms