Protein–RNA interactions for Protein: Q9H175

CSRNP2, Cysteine/serine-rich nuclear protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP2Q9H175 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP2Q9H175 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSRNP2Q9H175 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms