Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC8Q9H0W5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms