Protein–RNA interactions for Protein: Q9H000

MKRN2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN2Q9H000 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MKRN2Q9H000 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN2Q9H000 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms