Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GFRA4Q9GZZ7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GFRA4Q9GZZ7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms