Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CTDSP1Q9GZU7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTDSP1Q9GZU7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms