Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I9

LRRC27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC27Q9C0I9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC27Q9C0I9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC27Q9C0I9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms