Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CFAP74Q9C0B2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CFAP74Q9C0B2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CFAP74Q9C0B2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CFAP74Q9C0B2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CFAP74Q9C0B2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CFAP74Q9C0B2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CFAP74Q9C0B2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CFAP74Q9C0B2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
CFAP74Q9C0B2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CFAP74Q9C0B2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CFAP74Q9C0B2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CFAP74Q9C0B2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
CFAP74Q9C0B2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
CFAP74Q9C0B2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CFAP74Q9C0B2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CFAP74Q9C0B2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CFAP74Q9C0B2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFAP74Q9C0B2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFAP74Q9C0B2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFAP74Q9C0B2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFAP74Q9C0B2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFAP74Q9C0B2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFAP74Q9C0B2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFAP74Q9C0B2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CFAP74Q9C0B2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CFAP74Q9C0B2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CFAP74Q9C0B2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CFAP74Q9C0B2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CFAP74Q9C0B2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms