Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNTNAP4Q9C0A0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms