Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM4Q9C037 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM4Q9C037 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
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