Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GTPBP4Q9BZE4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTPBP4Q9BZE4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GTPBP4Q9BZE4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GTPBP4Q9BZE4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTPBP4Q9BZE4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms