Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZB8

CPEB1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1Q9BZB8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CPEB1Q9BZB8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPEB1Q9BZB8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms