Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PCGF6Q9BYE7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC34.32■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
PCGF6Q9BYE7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PCGF6Q9BYE7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms