Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MAP1LC3CQ9BXW4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3CQ9BXW4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms