Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS6

NUSAP1, Nucleolar and spindle-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUSAP1Q9BXS6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUSAP1Q9BXS6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUSAP1Q9BXS6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUSAP1Q9BXS6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUSAP1Q9BXS6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUSAP1Q9BXS6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUSAP1Q9BXS6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUSAP1Q9BXS6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUSAP1Q9BXS6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUSAP1Q9BXS6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUSAP1Q9BXS6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUSAP1Q9BXS6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUSAP1Q9BXS6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUSAP1Q9BXS6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUSAP1Q9BXS6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUSAP1Q9BXS6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUSAP1Q9BXS6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUSAP1Q9BXS6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUSAP1Q9BXS6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUSAP1Q9BXS6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NUSAP1Q9BXS6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUSAP1Q9BXS6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms