Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRIP1Q9BX63 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRIP1Q9BX63 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms