Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSBP3Q9BWW4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSBP3Q9BWW4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms