Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SSBP4Q9BWG4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP4Q9BWG4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms