Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
C9orf16Q9BUW7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C9orf16Q9BUW7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms