Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBB6Q9BUF5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBB6Q9BUF5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.3 ms