Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NDUFAF3Q9BU61 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFAF3Q9BU61 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFAF3Q9BU61 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFAF3Q9BU61 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFAF3Q9BU61 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFAF3Q9BU61 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFAF3Q9BU61 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFAF3Q9BU61 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFAF3Q9BU61 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFAF3Q9BU61 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFAF3Q9BU61 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFAF3Q9BU61 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFAF3Q9BU61 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDUFAF3Q9BU61 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFAF3Q9BU61 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFAF3Q9BU61 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFAF3Q9BU61 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFAF3Q9BU61 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFAF3Q9BU61 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFAF3Q9BU61 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFAF3Q9BU61 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFAF3Q9BU61 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFAF3Q9BU61 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDUFAF3Q9BU61 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFAF3Q9BU61 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFAF3Q9BU61 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFAF3Q9BU61 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFAF3Q9BU61 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFAF3Q9BU61 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFAF3Q9BU61 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFAF3Q9BU61 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDUFAF3Q9BU61 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms