Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM43Q9BTV4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM43Q9BTV4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms