Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAGR1Q9BTK6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAGR1Q9BTK6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAGR1Q9BTK6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAGR1Q9BTK6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PAGR1Q9BTK6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAGR1Q9BTK6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms