Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTKNQ9BST9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTKNQ9BST9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RTKNQ9BST9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms