Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS16

CENPK, Centromere protein K, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPKQ9BS16 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPKQ9BS16 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPKQ9BS16 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPKQ9BS16 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPKQ9BS16 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPKQ9BS16 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPKQ9BS16 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPKQ9BS16 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPKQ9BS16 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPKQ9BS16 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPKQ9BS16 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPKQ9BS16 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPKQ9BS16 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPKQ9BS16 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CENPKQ9BS16 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPKQ9BS16 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPKQ9BS16 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPKQ9BS16 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPKQ9BS16 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPKQ9BS16 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPKQ9BS16 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPKQ9BS16 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPKQ9BS16 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPKQ9BS16 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms