Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LARP6Q9BRS8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LARP6Q9BRS8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms