Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP1

PDCD2L, Programmed cell death protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2LQ9BRP1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDCD2LQ9BRP1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDCD2LQ9BRP1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms