Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOXF2Q9BQY4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOXF2Q9BQY4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms