Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PMCHL2Q9BQD1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PMCHL2Q9BQD1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMCHL2Q9BQD1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMCHL2Q9BQD1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMCHL2Q9BQD1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMCHL2Q9BQD1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMCHL2Q9BQD1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMCHL2Q9BQD1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMCHL2Q9BQD1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMCHL2Q9BQD1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMCHL2Q9BQD1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMCHL2Q9BQD1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMCHL2Q9BQD1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PMCHL2Q9BQD1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms