Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TREX2Q9BQ50 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TREX2Q9BQ50 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TREX2Q9BQ50 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TREX2Q9BQ50 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TREX2Q9BQ50 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TREX2Q9BQ50 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TREX2Q9BQ50 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TREX2Q9BQ50 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TREX2Q9BQ50 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TREX2Q9BQ50 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TREX2Q9BQ50 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TREX2Q9BQ50 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TREX2Q9BQ50 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TREX2Q9BQ50 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TREX2Q9BQ50 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TREX2Q9BQ50 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TREX2Q9BQ50 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TREX2Q9BQ50 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TREX2Q9BQ50 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TREX2Q9BQ50 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TREX2Q9BQ50 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms