Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPSNAP1Q9BPW8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NIPSNAP1Q9BPW8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP1Q9BPW8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP1Q9BPW8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP1Q9BPW8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP1Q9BPW8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP1Q9BPW8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP1Q9BPW8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP1Q9BPW8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP1Q9BPW8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP1Q9BPW8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP1Q9BPW8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP1Q9BPW8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP1Q9BPW8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP1Q9BPW8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NIPSNAP1Q9BPW8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPSNAP1Q9BPW8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPSNAP1Q9BPW8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPSNAP1Q9BPW8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPSNAP1Q9BPW8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPSNAP1Q9BPW8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPSNAP1Q9BPW8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NIPSNAP1Q9BPW8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIPSNAP1Q9BPW8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIPSNAP1Q9BPW8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIPSNAP1Q9BPW8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIPSNAP1Q9BPW8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NIPSNAP1Q9BPW8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms