Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CITED1Q99966 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CITED1Q99966 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms