Protein–RNA interactions for Protein: Q99766

ATP5S, ATP synthase subunit s, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5SQ99766 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP5SQ99766 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5SQ99766 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms