Protein–RNA interactions for Protein: Q96TC7

RMDN3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN3Q96TC7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RMDN3Q96TC7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms