Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST8

CEP89, Centrosomal protein of 89 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP89Q96ST8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP89Q96ST8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP89Q96ST8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP89Q96ST8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CEP89Q96ST8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CEP89Q96ST8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CEP89Q96ST8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CEP89Q96ST8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CEP89Q96ST8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CEP89Q96ST8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CEP89Q96ST8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CEP89Q96ST8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CEP89Q96ST8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CEP89Q96ST8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CEP89Q96ST8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CEP89Q96ST8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP89Q96ST8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms