Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SIN3AQ96ST3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
SIN3AQ96ST3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SIN3AQ96ST3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms