Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC37.64■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC37.64■■■■□ 3.62
IFT140Q96RY7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC37.6■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC37.6■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
IFT140Q96RY7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
IFT140Q96RY7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
IFT140Q96RY7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms