Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF13CQ96RJ3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms