Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARXQ96QS3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms