Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGLYRP2Q96PD5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGLYRP2Q96PD5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms