Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AGAP3Q96P47 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGAP3Q96P47 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms