Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCLT1Q96NL6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCLT1Q96NL6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms