Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNDC3BQ96NL0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNDC3BQ96NL0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNDC3BQ96NL0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms