Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB1

FOPNL, LisH domain-containing protein FOPNL, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOPNLQ96NB1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOPNLQ96NB1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOPNLQ96NB1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOPNLQ96NB1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOPNLQ96NB1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOPNLQ96NB1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOPNLQ96NB1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOPNLQ96NB1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOPNLQ96NB1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOPNLQ96NB1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOPNLQ96NB1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOPNLQ96NB1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOPNLQ96NB1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOPNLQ96NB1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOPNLQ96NB1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOPNLQ96NB1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOPNLQ96NB1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOPNLQ96NB1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOPNLQ96NB1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOPNLQ96NB1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOPNLQ96NB1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOPNLQ96NB1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FOPNLQ96NB1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOPNLQ96NB1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOPNLQ96NB1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOPNLQ96NB1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms