Protein–RNA interactions for Protein: Q96MP5

ZSWIM3, Zinc finger SWIM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM3Q96MP5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZSWIM3Q96MP5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZSWIM3Q96MP5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms