Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSMCE3Q96MG7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSMCE3Q96MG7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms